<div class="gmail_quote"><br>With regard to the following variant as an example:<br><div><span style="font-family:arial, sans-serif;font-size:13px;border-collapse:collapse"><div><a href="http://evidence.personalgenomes.org/SLC45A2-E272K" style="color:rgb(0, 0, 204)" target="_blank">http://evidence.personalgenomes.org/SLC45A2-E272K</a>: This is a pigmentation allele, so I set severity & treatability to 0.  Is that why this is still considered to be insufficiently evaluated?</div>

<div><br></div><div>On the same example, how do I calculate the case/controls 'significance'?  How do I calculate familial LOD score?</div><div>-Kim</div></span></div>
</div><br>